受震災影響，台灣高鐵6日原先公布台中以南暫停營運，不過經搶修後，高鐵公司下午表示，台中站至嘉義站區間已修復完成；為疏解台中站南下往彰化、雲林、嘉義地區以及南部地區北上之旅運人潮，將於下午16時2分起，每小時加開2班次往返台中站到嘉義站(沿途停靠彰化站、雲林站)之全車自由座(商務車廂除外)列車。
加開時間如下：南下列車自台中站，於16時2分起，每小時之2分及32分，各發一班次行駛至嘉義站之全車自由座列車，末班車為22時32分發車。北上列車自嘉義站，於16時10分起，每小時之10分及40分，各發一班次行駛至嘉義站至台中站之全車自由座列車，末班車為22時10分發車。
交通部長陳建宇說，高鐵在台南、嘉義區段各有災損，原本希望下午17時能有好結果，但工程車進去後，「發現要撤換電車線數量、長度都大於預期」，因此恢復營運時間必須向後延，對受影響旅客感到抱歉。行政院長張善政則表示，旅客不開心在所難免，台鐵、國道客運都盡全力在配合調度，希望旅客能體諒難預料的天災。他也呼籲，手中握有高鐵票卻無法南下的旅客不用急著退票，未來一年內都還可以進行退票，「先回家過年」。
